Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ldb2O55203 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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