Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms