Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srpk2O54781 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms