Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CrxO54751 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CrxO54751 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms