Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NudcO35685 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NudcO35685 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NudcO35685 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NudcO35685 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NudcO35685 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NudcO35685 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NudcO35685 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NudcO35685 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NudcO35685 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NudcO35685 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms