Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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