Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6bO35451 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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