Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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