Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ArxO35085 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ArxO35085 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ArxO35085 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ArxO35085 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ArxO35085 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ArxO35085 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ArxO35085 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ArxO35085 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ArxO35085 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ArxO35085 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms