Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms