Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sypl1O09117 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl1O09117 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms