Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms