Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp35M0QWN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms