Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm20878L7N244 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20878L7N244 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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