Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2888K7N746 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms