Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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