Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Gm21887J3QQ04 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm21887J3QQ04 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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