Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21900J3QP38 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21900J3QP38 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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