Protein–RNA interactions for Protein: J3QNZ6

Gm21874, Predicted gene, 21874, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21874J3QNZ6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21874J3QNZ6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21874J3QNZ6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21874J3QNZ6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms