Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc180J3QNE4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms