Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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