Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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