Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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