Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms