Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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