Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms