Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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