Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arid4aF8VPQ2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms