Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pcdh9F8VPK8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh9F8VPK8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms