Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms