Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrdnE9Q9K5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms