Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf169E9Q7F2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms