Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3250E9Q1M3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
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