Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo5cE9Q1F5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms