Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms