Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms