Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms