Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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