Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia4B8QI36 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms