Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms