Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms