Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssxb8B1AY40 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms