Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms