Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmem235B1AQL3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem235B1AQL3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms