Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms