Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm11127A7VMS2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11127A7VMS2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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