Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palm3A2TJV2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms