Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rtf1A2AQ19 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rtf1A2AQ19 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rtf1A2AQ19 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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