Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnksr1A2A9K7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnksr1A2A9K7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnksr1A2A9K7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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Cnksr1A2A9K7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnksr1A2A9K7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms