Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms